フリーマーチン検査は、異性複数産子（異性双子）の雌において、血液キメラの有無を雄特異的なDNA塩基配列の検出により推定しています。検出にはマルチプレックスPCR法により、雌雄共通のDNA塩基配列を同時に増幅することで、より正確な検査を行っています。また、雄特異的なDNA塩基配列には牛Y染色体特異的な反復配列を用いることで検出感度を高めています。増幅したPCR産物の検出は、ポリアクリルアミドゲル電気泳動（PAGE）法を用いています。
